Seqstudio Genetic Analyzer / Analisador Genético Seqstudio

Equipamento Multiusuário: Seqstudio Genetic Analyzer / Analisador Genético Seqstudio

Fabricante/Marca e modelo: ThermoFisher Scientific / Applied Biosystems™ SeqStudio™ Genetic Analyzer

Processo nº: FAPESP 2018/24304-2

Data de aquisição: 2019

Início de operação: Dezembro de 2019

Observações: O aparelho ficará aberto para a comunidade e deverá ser agendado pelo e-mail

lapemunifesp@gmail.com (Laboratório de Patógenos Fúngicos Emergentes).

Localização: Campus São Paulo, Escola Paulista de Medicina, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Laboratório de Patógenos Fúngicos Emergentes (Rua Botucatu, 862, Ed. de Ciências Biomédicas, 8º andar).

Foto(s)*

 Seqstudio1 Seqstudio2

*As imagens disponibilizadas no presente site têm função meramente ilustrativa.

Descritivo técnico: Analisador genético de DNA por eletroforese com 4 capilares. Capilares, matriz de separação de fragmentos (polímero) e tampão ânodo devem vir em único cartucho (SeqStudio™ Genetic Analyzer Cartridge, A33671) de fácil instalação suficiente para 125 injeções (500 amostras). Cartucho simples de ser removido, permite armazenamento em refrigerador.

Normas de utilização: O Laboratório de Patógenos Fúngicos Emergentes dispõe de um sequenciador concedido pelo programa equipamentos multiusuários da FAPESP (Processo nº 2018/24304-2). Este equipamento foi solicitado com o objetivo de proporcionar aos pesquisadores da EPM-UNIFESP acesso à técnica de sequenciamento e Análise de Fragmentos de DNA por meio da Eletroforese Capilar.

A utilização deste equipamento é aberta a comunidade acadêmica segundo as regras apresentadas a seguir:

- O usuário deverá solicitar o agendamento do equipamento para o responsável técnico, via e-mail (e-mail: lapemunifesp@gmail.com). O uso será informado segundo ordem de solicitação. Durante o pedido, favor mencionar: Pesquisador responsável; Laboratório; Título do Projeto; Agência Financiadora; Processo; Dados da Amostra; Nome; Origem; Tamanho do amplicon (em pares de bases); Demais características relevantes; Outras informações importantes. Quanto ao cadastramento dos projetos pelos pesquisadores, estes deverão assinar uma cópia do presente regulamento, manifestando concordância com os critérios de utilização do equipamento.

- Os usuários são corresponsáveis pelo equipamento e as despesas de custeio (material de consumo) serão por conta dos mesmos.

- Cabe ao usuário a preparação das amostras para sequenciamento assim como fornecer os reagentes necessários para a eletroforese capilar.

- O material para sequenciamento será recebido somente dentro do horário estabelecido pelo serviço e será processado por ordem de agendamento.

- Sugere-se o agendamento com pelo menos uma semana de antecedência.

- Os resultados serão fornecidos na forma de arquivos eletrônicos, salvos somente em CD (fornecido pelo usuário). Os dados gerados serão armazenados na memória interna do equipamento pelo prazo máximo de 30 dias, sendo apagados permanentemente após esse período.

- A análise dos resultados é de responsabilidade do usuário.

- Sugere-se que os trabalhos a serem publicados façam menção ao uso do Equipamento Multiusuário (FAPESP 2018/24304-2) nos "Agradecimentos - Acknowledgments".

- Em caso de desistência, solicitamos o envio de e-mail para lapemunifesp@gmail.comamrodrigues.amr@gmail.com ou amrodrigues@unifesp.br (Prof. Dr. Anderson Messias Rodrigues, EPM-UNIFESP) com o máximo de antecedência possível, a fim de liberar o horário para outros usuários. O não comparecimento sem aviso prévio implicará no impedimento de uso por duas semanas consecutivas.

- Em caso de dúvidas, entre em contato com lapemunifesp@gmail.comamrodrigues.amr@gmail.com ou amrodrigues@unifesp.br (Prof. Dr. Anderson Messias Rodrigues, EPM-UNIFESP).

 

Insumos e dicas

- Os usuários são corresponsáveis pelo equipamento e as despesas de custeio (material de consumo) serão por conta dos mesmos.

Lista básica de insumos:

N. de catálogo Descrição
A33671 / A41331 *SeqStudio™ Genetic Analyzer Cartridge
A33401 *SeqStudio™ Genetic Analyzer Cathode Buffer Container
A31923 SeqStudio™ Integrated Capillary Protector
4316813 *MicroAmp™ Optical 96-Well Reaction Plate
4326659 *MicroAmp™ Optical 96-Well Reaction Plate with Barcode
4316567 *MicroAmp™ Optical 8-Tube Strip, 0.2 mL
A36541 *Septa for SeqStudio™ Genetic Analyzer, 96 well
A36543 *Septa for SeqStudio™ Genetic Analyzer, 8 strip
403081 *MicroAmp™ 96-Well Tray/Retainer Set (Adapter for 8-Tube Strip)
A35640 *Reservoir Septa (For Cathode Buffer Container)
4401457 Hi‑Di™ Formamide
4337455 BigDye™ Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit
4376486 BigDye XTerminator™ Purification Kit
750011ML ExoSAP-IT™ Express PCR Product Cleanup Reagent
10297018 dNTP Set (100 mM)
10966034 Platinum™ Taq DNA Polymerase
4408399 GeneScan™ 600 LIZ™ Size Standard v2.0
401734 GeneScan™ 500 ROX™ dye Size Standard

*Observação: Note que os itens A33671 (ou A41331), A33401, 4316813 (ou 4326659 / 4316567), A36541 (ou A36543), 403081, A35640, são indispensáveis para o funcionamento e manutenção do equipamento e são de responsabilidade do usuário.

 

Site do equipamento:

https://www.thermofisher.com/br/en/home/life-science/sequencing/sanger-sequencing/sanger-sequencing-technology-accessories/seqstudio-genetic-analyzer.html

 

Professor Responsável: Prof. Dr. Anderson Messias Rodrigues (Fone: 5576-4551 Ramal 1544 ou Ramal 1513; e-mail: amrodrigues.amr@gmail.com e amrodrigues@unifesp.br)

Escola Paulista de Medicina, Depto. de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia

https://www.microimunounifesp.com.br/home/sobre-nos/docentes/prof-dr-anderson-messias-rodrigues/

 

Responsável(eis) técnico(s): Maria Cecília Zorat Yu – (Depto. de Oftalmologia e Ciências Visuais, EPM-Unifesp); e-mail: lapemunifesp@gmail.com.

 

Contato e forma de agendamento: - O usuário deverá solicitar o agendamento do equipamento para o Professor Responsável / Responsável técnico, via e-mail (lapemunifesp@gmail.com). O uso será informado segundo ordem de solicitação.

 

Agenda/Disponibilidade: De segunda à sexta-feira (exceto feriados), das 09h às 18h, conforme prévio agendamento durante o horário de funcionamento do Laboratório de Patógenos Fúngicos Emergentes.